NextSeq 500系统集高通量测序的性能和台式测序仪的简单性于一体，是目前唯一能够实现外显子组、转录组和全基因组测序的台式测序仪。它可以在两种模式下进行测序测试：高产量（High Output）和中等产量（Medium Output），20-1200可在一次运行中获得20-1200 GB数据是新一代无创产前胎儿遗传标记检测测序仪。

和MiSeq一样，NextSeq 500的整个过程也很简单。准备好的图书馆可以直接向系统取样。集成簇生成完成了单分子的自动复制和扩展。生成的dna簇在nextseq中在500系统中，使用Illumina边生成边测序（SBS）技术和专利的可逆终止子原理。拥有完善的SBS技术，NextSeq 500系统带来了行业领先的测序准确性。

有了NextSEQ 在500系统中，研究人员可以在一个平台上进行多个测序应用。NextSeq 500个NGS系统可以在一次运行中对人们的全基因组进行高覆盖（30倍）的测序。它还为许多流行的测序应用程序带来了周转时间。研究人员只需按下按钮，就可以在两种设备之间进行转换，在需要时进行低通量的测序应用程序或处理较小的样品批量。